El día que Taiju Oki, un adolescente fuerte pero algo palurdo, se decide por no declararle su amora Yuzuriha, sucede algo radical e inesperado: justo un segundo antes de la declaración, causas desconocidas llevan al total de la humanidad a convertirse instantáneamente en piedra. Después de 3.689 años y 158 días, durante los que ha luchado por no perder la consciencia y desaparecer, Taiju nalmente emerge de la piedra y vuelve a la normalidad. Aunque solo para descubrir que el resto de la humanidad jamas desperto de su sueño petreo. Luego se entera de que su amigo Senku, un genio absoluto de vocación científica y mentalidad mucho mas pragmática, también ha sobrevivido, y juntos encuentran una formula para volver a la vida a muchas de las estatuas que nose han partido en pedazos con el paso de los siglos. Llegados a este punto se marcan como objetivo reconstruir la civilización desde sus cimientos y tratar de alcanzar el mismo desarrollo tecnológico que había antes de la catastrofe de origen desconocido. Pero tienen que hacerlo de la forma mas acelerada posible ya que no quieren morirse en la edad de piedra. La misión es ir paso apaso reproduciendo todo lo que fue necesario para llegar a convertir las materias primas de la naturaleza en las cosas que hoy damos por sentadas, como ordenadores, móviles y aviones. Los acompañaran en este desafío Yuzuriha, el eterno amor de Taiju, y otros variopintos personajes. Lograran su objetivo sin que las salvajes bestias que ahora campan a sus anchas por el mundo se hagan un bocata de humano antes? Hay mas gente que ha despertado sin ayuda en este reverdecido mundo? Y si hay mas pero no todos tienen objetivos tan pacifistas? Servirá la combinación de cerebro y músculos como piedra fundacional para esta nueva Edad de Piedra de la humanidad? Todas estas dudas y muchas mas serán respondidas en el mismísimo primer tomo, abriendo el abanico de incógnitas para explorar este nuevo mundo.